Jeho otcom je jej manžel, herec a komik Taran Killam, s ktorým má už päťročnú dcéru Shaelyn Cado. Tridsaťdvaročná rodáčka z Vancouveru spomenula nový prírastok do rodiny v rozhovore pre portál Bustle.com, pohlavie ani meno dieťaťa však neprezradila.
Smulders a 32-ročný Killam, ktorý si zahral v snímkach ako Medové týždne (2003), 12 rokov otrokom (2013) či Drsňáčky (2013), ale objavil sa aj ako Gary Blauman v šiestich epizódach Ako som spoznal vašu mamu, sa zasnúbili v januári 2009. Svadba sa konala 8. septembra 2012 v Kalifornii.