McGregor a Mavrakis sa zosobášili v roku 1995 a majú spolu štyri deti. Pod rozpad dlhotrvajúceho manželstva sa podpísalo hercovo vzplanutie ku kolegyni zo seriálu Fargo, Mary Elizabeth Winsteadovej (35). S tou žije dodnes.

Po dlhých mesiacoch ťahaníc niekdajších manželov konečne rozviedli, informuje denník The Blast. Dvojica, ktorá spolu žila vyše 20 rokov, sa tento mesiac finančne vysporiadala a podpísala rozvodovú dohodu, píše spomínaný denník. Tá sa týkala nielen majetku, ale aj výživného na ich štyri spoločné deti. Herec, ktorého preslávila rola v Trainspottingu (1996), podal žiadosť o rozvod v roku 2018.
V roku 2017 sa rozpadlo aj manželstvo herečky Mary Elizabeth Winsteadovej, ktorá dala zbohom manželovi, Rileymu Stearnsovi, s ktorým sa postavila pred oltár v roku 2010.