Tridsaťšesťročná rodáčka z Ria de Janeiro sa s Chickom zosobášila v novembri 2011, no vlani v júni podala žiadosť o rozvod. V tom čase už chodila s hercom Benom McKenziem, ktorému začiatkom tohto mesiaca porodila dcéru Frances Laiz Settu Schenkkan.
Aj s Chickom má herečka a hviezda filmu Deadpool či seriálu Homeland dieťa – syna Juliusa. O tom, v koho opatrovníctve chlapec bude, ako aj o alimentoch, rozhodne súd neskôr.
Morena Baccarin momentálne účinkuje v seriáli Gotham, vďaka ktorému sa zoznámila práve so súčasným partnerom – kolegom McKenziem., ktorý je okrem iného známy aj rolou v seriáli O.C. Kalifornia.